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模拟类型
蛋白-小分子
P450蛋白-小分子
蛋白-肽
蛋白-蛋白
蛋白-DNA
肽-小分子
小分子-小分子
其他
蛋白文件(或者蛋白与配体的复合物文件)
选择
配体文件(例如小分子/肽文件,如果蛋白文件以包含配体,则无需上传)
选择
模拟时长(ns)
100
200
500
1000
力场(蛋白与配体模拟的力场通常选用AMBER14SB)
AMBER14SB
AMBER99SB-ILDN
OPLS-AA/L all-atom
CHARMM27 all-atom
分析方案
模拟分析套餐1(¥ 190 元,快速分析:1400字分析报告,含RMSD/RG/RMSF/质心演变/SASA/氢键/配体构象分布分析)
模拟分析套餐2(¥ 280 元,全面分析:2600字分析报告,套餐1基础上增加:MMPBSA结合能计算/氨基酸结合能分解/关键氨基酸分析/相互作用构象图4张/氢键频率与稳定性分析)
模拟分析套餐3(¥ 340 元,高级分析:3000字分析报告,套餐2基础上增加:PCA主成分/自由能形貌/B-Factor/表面电势分布)
备注
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