Easy2MD 分子动力学模拟
交付内容
交付结果包含《材料与方法》、《分子动力学模拟分析报告》、相应内容的高清图和原始数据
适用范围
以下分子动力学模拟价格和体系适用于：小分子-蛋白体系、药物成分-疾病靶点体系、底物-蛋白酶体系
可用于评估小分子与蛋白的结合稳定性，中药成分与疾病靶点的结合预测，酶与底物的相互作用，酶突变的机理解析，酶的突变点预测等等
其他类型的模拟，例如蛋白-蛋白体系、肽-蛋白体系等等，请咨询微信客服
价格说明
模拟体系与蛋白和小分子的大小呈正相关，因此蛋白超过200个氨基酸时，每增加100个氨基酸，需要额外支付20元
一般情况下，蛋白太大的，可联系客服，截取其中部分结构域来进行分子模拟，以降低费用
若模拟项目较多时，请联系客服，客服将针对您的模拟项目提供专业的建议和优惠的价格
专业建议
蛋白结构的选择较为关键，可联系客服帮助选择最适蛋白结构，以提高模拟结果的正确率和可信度，以期发表优质论文
套餐1
1对蛋白-小分子
¥190
6个分析项目
分析报告约1200字
样图
?将鼠标移至功能项上可查看详细示例图
-
材料与方法
-
模拟结果分析
-
RMSD
-
Rg/Rog/Gyrate
-
RMSF
-
小分子-蛋白距离演变
-
SASA/Buried SASA
-
轨迹构象文件
- 氢键数量演变
- 结合能演变
- MMPBSA结合能分析
- 氨基酸结合能贡献/关键氨基酸分析
- 相互作用结构分析图
- 小分子轨迹构象分布图
- 氢键频率/占有率分析
- PCA主成分分析
- 自由能形貌FEL
- B-Factor
- 表面电势分布
套餐2
1对蛋白-小分子
¥290
12个分析项目
分析报告约2500字
样图
?将鼠标移至功能项上可查看详细示例图
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材料与方法
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模拟结果分析
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RMSD
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Rg/Rog/Gyrate
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RMSF
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小分子-蛋白距离演变
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SASA/Buried SASA
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轨迹构象文件
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氢键数量演变
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结合能演变
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MMPBSA结合能分析
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氨基酸结合能贡献/关键氨基酸分析
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相互作用结构分析图
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小分子轨迹构象分布图
- 氢键频率/占有率分析
- PCA主成分分析
- 自由能形貌FEL
- B-Factor
- 表面电势分布
套餐3
1对蛋白-小分子
¥390
17个分析项目
分析报告约3100字
样图
?将鼠标移至功能项上可查看详细示例图
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材料与方法
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模拟结果分析
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RMSD
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Rg/Rog/Gyrate
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RMSF
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小分子-蛋白距离演变
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SASA/Buried SASA
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轨迹构象文件
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氢键数量演变
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结合能演变
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MMPBSA结合能分析
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氨基酸结合能贡献/关键氨基酸分析
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相互作用结构分析图
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小分子轨迹构象分布图
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氢键频率/占有率分析
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PCA主成分分析
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自由能形貌FEL
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B-Factor
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表面电势分布
分析样图
套餐1
基础分析套餐 · 6个分析项目
包含RMSD、RMSF、Rg等基础分析，适合初步评估分子动力学模拟结果
套餐2
进阶分析套餐 · 12个分析项目
在基础分析基础上，增加结合能、氢键分析等，适合深入研究分子间相互作用
套餐3
高级分析套餐 · 17个分析项目
包含全面的分析项目，额外增加PCA、FEL等高级分析，适合深度研究和论文发表
分析报告
专业的分析报告文档
提供详细的分析报告，包含材料方法、结果分析、数据解读等完整内容
模拟流程
文件上传或文件发送
上传蛋白/小分子文件，或通过微信发送给客服
→
体系评估
联系客服，以评估模拟体系，确定蛋白结构选择、模拟价格
→
项目付款
确认价格后付款或预付款，如需机构（学校/医院/研究院等）公账打款可联系客服沟通细节
→
开始模拟
收到付款或预付款后，立即开始分子动力学模拟
→
数据处理
模拟完成后进行数据处理和分析
→
交付确认
发送分析结果，客户确认收货和确认打款
交付周期
标准交付周期
模拟交付周期根据具体情况而定，一般是2-7天
如需加急服务，请联系微信客服沟通具体需求
服务说明
- 分子对接限额免费使用，分子模拟将赠送分子对接代金券，详情可联系客服
- 分子动力学模拟的分析套餐分为3个档次，研究者可以根据自己的具体需要选择不同的套餐
- 分子模拟较为复杂，为避免出错，上传文件后请联系微信客服对模拟体系进行评估与确认
- 可以开具发票，如需开具发票，请联系微信客服